De tre häktades misstänkta för grov trolöshet mot huvudman, ett brott som kan ge upp till sex års fängelse.
Enligt Upplandsnytt tros de tre ha ägnat sig åt den brottsliga verksamheten i över ett år men det är oklart exakt hur mycket pengar som försvunnit.
Börsnoterade Bahnhof startades i Uppsala men har nu sitt huvudkontor i Kista och ett dotterbolag i Borlänge.
En av de häktade har erkänt sig skyldig.
Åtal ska vara väckt senast 11 okotober.
Tre häktades för miljonsvindel
Tre personer häktades på fredagen vid Uppsala tingsrätt misstänkta för att ha fört över miljontals kronor från internetoperatören Bahnhof där de varit anställda till ett företag de själva drivit.
Så jobbar vi med nyheter