Jan Stahle var hela sitt yrkesverksamma liv, åren 1950–1990, verksam vid Akademiska sjukhusets öron-, näs- och halsklinik i Uppsala. Han disputerade 1958 om undersökningsmetoder av balanssinnet och utsågs samma år till docent i otorhinolaryngologi. Den fortsatta forskningen ägnades åt yrsel- och balansrubbningar i samma generösa anda som tidigare initierats av nobelpristagaren Robert Bárány som var den förste professorn och klinikchefen vid kliniken. Stahle tjänstgjorde som biträdande överläkare 1961–1978 och från 1979 fram till pensionen 1990 som professor och överläkare samt tillika klinikchef. Under hans tid som professor har ett stort antal avhandlingar utgått från institutionen. Resultaten från avhandlingarna befäste klinikens roll som internationellt framstående centrum inom otoneurologin. Stahle byggde systematiskt upp ett omfattande internationellt kontaktnät och många framstående läkare från hela världen gästade kliniken för att studera såväl kirurgi som för att deltaga i forskningen.
Nya kirurgiska metoder introducerades. Jan Stahle initierade i mitten av 1980-talet, tillsammans med professorn i neurokirurgi Urban Pontén, kirurgisk behandling av tumörer på balansnerven. Stahle genomförde också en viss subspecialisering vid kliniken vilken vidareutvecklades och slutfördes av hans efterträdare.
Ett flertal nordiska och internationella kongresser har arrangerats under Jan Stahles ledning i Uppsala. Han var ledamot i Vetenskapssocieteten och President för den internationella prestigefyllda medicinska organisationen Bárány Society 1979-1990.
Stahle förmedlade läkekonst, engagemang och utstrålade positiv kraft i sin etiska livssyn och som förts vidare till senare generationer medicinare. Minnet av Jan Stahle är ljust. En högt skattad gentleman har gått ur tiden.