Förbudet, som är en "förebyggande åtgärd" för att hindra virusspridningen, träder i kraft på fredag och ska gälla mars månad ut.
– Vi tar hand om argentinarnas hälsa, säger Fernández.
Undantag gäller transport till närliggande mataffärer och apotek, vilka tillåts hålla öppet. 128 personer i landet uppges ha smittats, varav tre har avlidit.