Enligt den senaste prognosen ska tågen avgå normalt från cirka klockan 05 på måndagsmorgonen. I nuläget är endast ett av två spår öppet för trafik till följd av underhållsarbeten.
De sträckor som påverkas är Uppsala - Arlanda/Märsta - Stockholm. Förseningarna berör samtliga fjärr- och lokaltåg.
LÄS MER: Tågstörningar att vänta
Vid 21-tiden på söndagskvällen uppgick förseningarna för tågavgångar mellan Uppsala och Stockholm till mellan två och 30 minuter.
Orsaken är byggandet av järnvägsövergångar mellan Uppsala och Knivsta, enligt Trafikverket.