Problemen började sent på eftermiddagen och fortsatte långt in på kvällen. Vid 20-tiden uppgav Trafikverkets pressjour att förseningarna höll på att köras in. Vid 22-tiden rullade trafiken i stort sett som vanligt, enligt Trafikverkets hemsida. Förseningarna låg tidigare under kvällen på 30–40 minuter.
Orsaken till förseningarna var att personer av okänd anledning uppehöll sig längs spåren, bland annat i tunnlar söder om Stockholm. Ett växelfel i Älvsjö förvärrade läget. Eftersom störningarna skedde söder om Stockholm berördes inte SJ-pendeln mellan Stockholm och Uppsala i någon större utsträckning.