Vittnet larmade polisen, som skickade ut en patrull.
Enligt vakthavande befäl vid Uppsalapolisen anträffades en misstänkt gärningsman i närområdet.
Den misstänkte mannen, som är i 35-årsåldern, omhändertogs för fylleri och kommer under fredagen, efter att han nyktrat till, att delges misstanke om skadegörelse.
Enligt uppgift ska mannen ha kastat en större sten rakt genom en glasruta på Åhlens.