Två brandstationer larmades till platsen efter att branden upptäckts vid 21-tiden på kvällen.
Det var en silo fylld med torv, en av tolv stycken som finns vid värmeverket, som av okänd anledning fattat eld.
- Eftersom att det är så hårt packat så är det svårsläckt, säger Fredrik Ödman på Uppsala brandförsvar.
Enligt en operatör vid Sos alarm löste räddningstjänsten problemet genom att fylla silon med vatten.
-Man var färdig där vid midnatt ungefär, och nu har man lämnat platsen, säger operatören.