Anledningen var att obehöriga tagit sig in på spårområdet, uppger Trafikverket på sin hemsida.
Arlanda Express påverkades inte av stoppet.
Polis kallades till platsen och vid 11.15-tiden rullade tågen som vanligt igen.
Nytt stopp påverkade tågtrafiken
Det var totaltstopp i tågtrafiken vid Arlanda C, vilket påverkade pendeltåg på sträckan Uppsala-Stockholm City-Södertälje samt fjärr- och regionaltåg på sträckan Uppsala-Arlanda-Stockholm C.
Så jobbar vi med nyheter